Nace en Sevilla, España en 1532. Realiza estudios de
Medicina y en 1557 llega a la Nueva España.
Es el primer médico titulado en el país, obtiene
su grado en 1567. Más tarde se ordena como sacerdote y dedica toda su
vida al ejercicio de su carrera. Realizó dos obras que son fundamentales
para el estudio de la historia de la medicina en México: Tratado breve
de anatomía y cirugía, y de algunas enfermedades, que mas comunmente
suelen haber en esta Nueva España, y el Tratado Breve de Medicina y de
todas las enfermedades hecho por el padre Fray Agustín Farfán.
Este libro se publicó en 1592 y básicamente era
un manual para los habitantes de los pueblos alejados, donde no había
hospitales ni boticas.
En sus obras se observa la influencia indígena
sobre la ciencia médica europea de su tiempo, que muestra la manera en
que las creencias mágicas y la ciencia se unían para aliviar las
enfermedades.